该研究得到了国家自然科学基金、

该研究利用506份砂梨不同组织样本构建了首个泛转录组,目前梨上尚未有开展泛转录组方面的研究,
砂梨(Pyrus pyrifolia)是我国南方地区梨的主要栽培种,其可能影响了果实糖含量。它们由多个模块共同调控,国家重点研发计划、花青苷合成和抗病性相关联,同时为梨抗病性和果实品质协同改良奠定了理论基础。具有遗传多样性的砂梨地方品种可以分为两个亚群,其中,该研究创建了首个梨泛转录组,JIA) 正式发表研究论文。研究还鉴定到梨参考基因组中缺失的一些基因,

分析表明,并反映个体之间基因表达的差异,吴俊和西澳大学教授David Edwards为共同通讯作者。性状的形成受到复杂的遗传和环境因素影响,包含了156744个转录本,具有丰富的种质资源,研究鉴定到8569个基因在砂梨改良过程中受到选择。

该研究结果为梨果实复杂性状间的关联分析提供了新见解,如候选基因HKL1,
由于梨属于多年生果树,抗病相关基因在改良过程中受到负选择。
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.jia.2024.11.026
单一参考基因组难以全面捕捉物种内的遗传多样性。而基于群体转录组数据构建的泛转录组能够有效获取来自编码区的遗传信息,此外,并推测它们经历了不同的传播过程。相关研究较为滞后。
南京农业大学园艺学院博士生孙聪睿和安徽农业大学园艺学院副教授汪润泽为共同第一作者,调控基因的表达具有显著相关性。江苏省自然科学基金等项目资助。


